Purtroppo è una cosa che succede anche a me...
Onestamente nn mi sono mai preoccupato della cosa: semplicemente cercavo di non spostare il cursore dell'avanzamento di riproduzione del film...
Se nn ricordo male però, con altri player non mi dava problemi. Provato con il Divx Player? E con VLC?
Altrimenti se vuoi potresti provare a "fixare" il file con VideoFix... E' un buon programma molto semplice che ti permette di correggere certi errori dei file divx...
Onestamente non l'ho mai provato con degli m2v, ma potrebbe funzionare!