Probabilmente è dovuto a Winblows
Winzoz fa spesso di queste cosacce: a volte non riconosce le periferiche (a me lo faceva anche con quelle interne) e quindi i programmi rimangono spiazzati.
E' possibile che il tuo hard disk esterno non sia stato riconosciuto subito, e quindi emule quand'è partito ha visto che la directory dove scaricava non c'era + e ha spostato tutto su C (disco interno).
Se questa teoria è giusta è probabile che tu abbia perso qualche file nello spostamento :cry: (ARGH! Il terrore di tutti gli utenti del mulo!!! La perdita dei file...)
Mi confermi?! Hai Winsozz XP!? ;)